Wizualizacja logistycznych GAM

Nieliniowe modelowanie z użyciem uogólnionych modeli addytywnych (GAM) w R

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

Przekształcanie skal

Wykresy log-odds

plot(binom_mod)

Konwersja efektów cząstkowych

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Konwersja efektów cząstkowych (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Dodawanie wyrazu wolnego

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Dodawanie wyrazu wolnego (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Uwzględnianie niepewności wyrazu wolnego

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE)

Ulepszanie wykresu

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE, 
     shade.col = "lightgreen", col = "purple")

Czas na ćwiczenia!

Nieliniowe modelowanie z użyciem uogólnionych modeli addytywnych (GAM) w R