Ustawianie i przeglądanie kluczy data.table

Łączenie danych z data.table w R

Scott Ritchie

Postdoctoral Researcher in Systems Genomics

Ustawianie kluczy `data.table`

Ustawianie kluczy eliminuje konieczność podawania argumentu on przy złączeniach

Przydatne, gdy data.table jest używana w wielu złączeniach

Sortuje data.table w pamięci według kolumn kluczowych

Przyspiesza filtrowanie i złączenia

Można ustawić wiele kolumn jako klucze

Funkcja `setkey()`

Kolumny kluczowe są przekazywane jako argumenty

setkey(DT, ...)

setkey(DT, key1, key2, key3)

setkey(DT, "key1", "key2", "key3")

# To set all columns in DT as keys
setkey(DT)

Funkcja `setkey()`

Ustaw klucze obu data.tables przed złączeniem

setkey(dt1, dt1_key)
setkey(dt2, dt2_key)

Wykonaj złączenia wewnętrzne, prawe i lewe:

# Inner join dt1 and dt2
dt1[dt2, nomatch = 0] 

# Right join dt1 and dt2
dt1[dt2] 

# Left join dt1 and dt2
dt2[dt1]

Programowe ustawianie kluczy

Kolumny kluczowe są podawane jako wektor znakowy

keys <- c("key1", "key2", "key3")
setkeyv(dt, keys)

Pobieranie kluczy

haskey() sprawdza, czy klucze zostały ustawione

haskey(dt1)

TRUE

key() zwraca ustawione kolumny kluczowe

key(dt1)

"dt1_key"

Pobieranie kluczy

Gdy klucze nie są ustawione

haskey(dt_no_key)

FALSE

key(dt_no_key)

NULL

Przeglądanie wszystkich `data.tables` i ich kluczy

tables()

     NAME        NROW NCOL MB COLS                       KEY           
[1,] dt             3    4  1 key1,key2,key3,value       key1,key2,key3
[2,] dt1        1,000    3  1 dt1_key_column,value,group dt1_key
[3,] dt2        1,000    2  1 dt2_key_column,time        dt2_key
[4,] dt_no_key      5    2  1 id,color                                 
Total: 4MB

Czas na ćwiczenia!

Łączenie danych z data.table w R