Testy hipotez

Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Justin Bois

Lecturer, Caltech

Wpływ mutacji na aktywność

1 Dane udostępnione przez Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou i David Prober, Caltech
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Definicje genotypów

  • Typ dziki: brak mutacji

  • Heterozygota: mutacja na jednym z dwóch chromosomów

  • Mutant: mutacja na obu chromosomach
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Wpływ mutacji na aktywność

1 Dane udostępnione przez Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou i David Prober, Caltech
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Wpływ mutacji na aktywność

1 Dane udostępnione przez Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou i David Prober, Caltech
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Test hipotezy

Ocena, na ile obserwowane dane są zgodne z założoną hipotezą

Studia przypadków w myśleniu statystycznym

p-wartość

Prawdopodobieństwo uzyskania wartości statystyki testowej co najmniej tak ekstremalnej jak zaobserwowana, przy założeniu prawdziwości hipotezy zerowej

Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Statystyka testowa

  • Pojedyncza liczba obliczana na podstawie danych obserwowanych i symulowanych pod hipotezą zerową

  • Stanowi podstawę do porównań
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

p-wartość

Prawdopodobieństwo uzyskania wartości statystyki testowej co najmniej tak ekstremalnej jak zaobserwowana, przy założeniu prawdziwości hipotezy zerowej

Wymaga jasnego określenia:

  • Hipotezy zerowej, którą można symulować
  • Statystyki testowej obliczalnej z danych obserwowanych i symulowanych
  • Definicji pojęcia co najmniej tak ekstremalnej jak
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Procedura testowania hipotez

  • Jasno sformułuj hipotezę zerową
  • Zdefiniuj statystykę testową
  • Wygeneruj wiele zestawów danych symulowanych przy hipotezie zerowej
  • Oblicz statystykę testową dla każdego zestawu symulowanego
  • p-wartość to udział symulacji, w których statystyka testowa jest co najmniej tak ekstremalna jak dla danych rzeczywistych
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Specyfikacja testu

Hipoteza zerowa: długości aktywnych epizodów u ryb typu dzikiego i heterozygot mają identyczny rozkład

Statystyka testowa: różnica średnich długości aktywnych epizodów między heterozygotami a typem dzikim

Co najmniej tak ekstremalna jak: statystyka testowa jest większa lub równa zaobserwowanej

Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Test permutacyjny

Dla każdej repliki:

  • Wymieszaj etykiety punktów danych
  • Oblicz statystykę testową
perm_reps = dcst.draw_perm_reps(
    data_a, data_b, dcst.diff_of_means, size=10000
)

p-wartość to udział replik co najmniej tak ekstremalnych jak zaobserwowana

p_val = np.sum(perm_reps >= diff_means_obs) / len(perm_reps)
Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Czas na ćwiczenia!

Studia przypadków w myśleniu statystycznym

Preparing Video For Download...