绘制泊松回归

R 中的广义线性模型

Richard Erickson

Instructor

何时对泊松用 geom_smooth

最适用于连续型自变量
例如：剂量增加与每平方厘米癌细胞数增加
否则用箱线图等工具

癌细胞剂量研究

模拟数据
剂量-反应
- x：剂量
- y：每平方厘米癌细胞数

绘制散点

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
    geom_point()

带点的 ggplot

抖动散点

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)

ggplot2 抖动点示例。

geom_smooth()

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)
   geom_smooth()

抖动点上的默认 geom_smooth() 示例

使用 geom_smooth() 的 GLM

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)
   geom_smooth(method = 'glm')

使用 geom_smooth() 和默认 GLM（即 LM）的示例

使用 geom_smooth() 的泊松 GLM

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05) +
   geom_smooth(method = 'glm', method.args = list(family = 'poisson'))

泊松回归图示例

步骤概览

绘制不重叠的点
添加泊松趋势线
美化图形（此处未完成）

开始练习！

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