Bioconductor 项目

R 中的 Bioconductor 入门

James Chapman

Curriculum Manager, DataCamp

Bioconductor

Bioconductor

1 Bioconductor (www.bioconductor.org)
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我们测量什么，为什么？

  • 结构：元素、区域、大小、顺序、关系

结构部件

  • 功能：表达、水平、调控、表型

功能

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如何安装 Bioconductor 软件包？

  • Bioconductor 有自己的仓库和安装方式
# Install BiocManager
install.packages("BiocManager")

# Install the GenomicRanges package
BiocManager::install("GenomicRanges")
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Bioconductor 版本与软件包版本

# Load BiocManager
library(BiocManager)


# Check Bioconductor version
version()
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检查软件包版本

# Load GenomicRanges
library(GenomicRanges)


# Check versions for reproducibility
sessionInfo()
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软件包更新

# Check for package updates
valid()
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Passons à la pratique !

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