差异表达分析

使用 R 中的 Bioconductor 进行 RNA-Seq 分析

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

DESeq2

使用 R 中的 Bioconductor 进行 RNA-Seq 分析

差异表达分析：DESeq2 小册子

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DESeq2 小册子

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DESeq2 工作流

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导入 DESeq2 数据

# Read in raw counts
wt_rawcounts <- read.csv("fibrosis_wt_rawcounts.csv") 
View(wt_rawcounts)

纤维化 wt 原始计数

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导入 DESeq2 数据：元数据

# Read in metadata
wt_metadata <- read.csv("fibrosis_wt_metadata_unordered.csv") 
View(wt_metadata)

纤维化 wt 元数据

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