用于估计平滑生存曲线的Weibull模型

R 中的生存分析

Heidi Seibold

Statistician at LMU Munich

为何使用Weibull模型?

R 中的生存分析

在R中计算Weibull模型

Weibull模型:

wb <- survreg(Surv(time, event) ~ 1, data)
R 中的生存分析

在R中计算Weibull模型

Weibull模型:

wb <- survreg(Surv(time, event) ~ 1, data)

Kaplan–Meier估计:

km <- survfit(Surv(time, event) ~ 1, data)
R 中的生存分析

从Weibull模型计算指标

wb <- survreg(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)

90%的患者在此时间点后仍存活:

predict(wb, type = "quantile", p = 1 - 0.9, newdata = data.frame(1))
       1 
384.9947

p = 1 - 0.9,因为分布函数等于1减去生存函数。

R 中的生存分析
wb <- survreg(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)

生存曲线:

surv <- seq(.99, .01, by = -.01)

t <- predict(wb, type = "quantile", p = 1 - surv, newdata = data.frame(1)) head(data.frame(time = t, surv = surv))
       time surv
 1  60.6560 0.99
 2 105.0392 0.98
 3 145.0723 0.97
 4 182.6430 0.96
 5 218.5715 0.95
 6 253.3125 0.94
R 中的生存分析

让我们来练习!

R 中的生存分析

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