解读基因列表

在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析

Peter Humburg

Statistician, Macquarie University

在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析

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查找富集的基因集

library(chipenrich)

chipenrich(peaks, genome='hg19', 
           genesets = 'hallmark',
           locusdef = 'nearest_tss')
在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析

让我们练习吧！

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