Cum găsesc blocajul?

Scrierea codului R eficient

Colin Gillespie

Jumping Rivers & Newcastle University

Profilarea codului

Ideea generală este să:

Rulați codul
La fiecare câteva milisecunde, înregistrați ce se execută
Rprof()este inclus în R și face exact asta
- Dificil de utilizat
Utilizați profvis în schimb

Setul de date IMDB

Din pachetul ggplot2movies

data(movies, package = "ggplot2movies")
dim(movies)

58788    24

DataFrame: aproximativ 60.000 de rânduri și 24 de coloane
Fiecare rând corespunde unui film

Braveheart

braveheart = movies[7288,]

Year	Length	Rating
1995	177	8.3

Exemplu: Braveheart

# Load data
data(movies,
     package = "ggplot2movies")
braveheart <- movies[7288,]
movies <- movies[movies$Action==1,]

plot(movies$year, movies$rating,
     xlab = "Year", ylab = "Rating")

# local regression line
model <- loess(rating ~ year,
               data = movies)
j <- order(movies$year)
lines(movies$year[j],
      model$fitted[j],
      col = "forestgreen")

points(braveheart$year,
       braveheart$rating,
       pch = 21,
       bg = "steelblue")

Profvis

RStudio are suport integrat pentru profilare cu profvis
- Selectați codul pe care doriți să îl profilați
- Profile -> Profile Selected lines

Linia de comandă

library("profvis")

profvis({

data(movies, package = "ggplot2movies") # Load data
braveheart <- movies[7288,]
movies <- movies[movies$Action == 1,]
plot(movies$year, movies$rating, xlab = "Year", ylab="Rating")
model <- loess(rating ~ year, data = movies) # loess regression line
j <- order(movies$year)
lines(movies$year[j], model$fitted[j], col="forestgreen", lwd=2)
points(braveheart$year, braveheart$rating,
     pch = 21, bg = "steelblue", cex = 3)

})

Ce linie credeți că va fi cea mai lentă?

Să exersăm!

Scrierea codului R eficient