Filtre

Analiza imaginilor biomedicale în Python

Stephen Bailey

Instructor

Filtre

Exemple de imagini filtrate

Convoluție cu un filtru de clarificare

exemplu-convoluție

Convoluție cu un filtru de clarificare

rezultat-convoluție

By Michael Plotke - Own work, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=24288958

Convoluție de imagini

import imageio.v2 as imageio
import scipy.ndimage as ndi

im=imageio.imread('foot-xray.jpg')

weights = [[.11,  .11, .11],
           [.11,  .12, .11],
           [.11,  .11, .11]]

im_filt = ndi.convolve(im, weights)

fig, axes = plt.subplots(2, 1)
axes[0].imshow(im, cmap='gray')
axes[1].imshow(im_filt,cmap='gray')
plt.imshow()

radiografie de picior netezită

Funcții de filtrare

scipy.ndimage.filters include:

median_filter()
uniform_filter()
maximum_filter()
percentile_filter()

ndi.median_filter(im, size=10)

picior-filtru-median

Filtrare Gaussiană

Distribuția Gaussiană în 1 dimensiune Distribuție Gaussiană 1D

ndi.gaussian_filter(im, sigma=5)

Blur la sigma = 5

Distribuția Gaussiană în 2 dimensiuni By Kghose at the English language Wikipedia, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2550031

ndi.gaussian_filter(im, sigma=10)

Blur la sigma = 10

Vamos praticar!

Analiza imaginilor biomedicale în Python