Măști

Analiza imaginilor biomedicale în Python

Stephen Bailey

Instructor

Imagine brută

CreierComplet

Mască de imagine

Mască

Crearea măștilor

Operațiile logice returnează True / False pentru fiecare pixel

mat = np.array([[1, 2, 3],
                [4, 5, 6],
                [7, 8, 9]])

mat > 5

np.array([[False, False, False],
          [False, False, True ],
          [True,  True,  True ]])

Operații uzuale

hist=ndi.histogram(im, 0, 255, 256)

mask1 = im > 32

histogramă picior

mască picior 1

mask2 = im > 64

mask3 = mask1 & ~mask2

mască picior 2

mască picior 1 și 2

np.where(condition, x, y) controlează ce date trec prin mască.

import numpy as np

im_bone = np.where(im > 64, im, 0)

plt.imshow(im_bone, cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()

imagine fără zone non-osoase

m = np.where(im > 64, 1, 0)

mască picior 1

ndi.binary_dilation(m,iterations=5)

dilatare binară mască picior

ndi.binary_erosion(m,iterations=5)

eroziune binară mască picior

Analiza imaginilor biomedicale în Python