Efectuarea ACP în R

Algebră liniară pentru știința datelor în R

Eric Eager

Data Scientist at Pro Football Focus

Date NFL Combine

head(select(combine, height:shuttle))
  height weight forty vertical bench broad_jump three_cone shuttle
1     71    192  4.38     35.0    14        127       6.71    3.98
2     73    298  5.34     26.5    27         99       7.81    4.71
3     77    256  4.67     31.0    17        113       7.34    4.38
4     74    198  4.34     41.0    16        131       6.56    4.03
5     76    257  4.87     30.0    20        118       7.12    4.23
6     78    262  4.60     38.5    18        128       7.53    4.48
Algebră liniară pentru știința datelor în R

Date NFL Combine

prcomp(A)
Standard deviations (1, .., p=8):
[1] 46.7720885  6.6356959  4.7108443  2.2950226  1.6430770  0.2513368  0.1216908  0.1143365

Rotation (n x k) = (8 x 8):
                    PC1          PC2           PC3           PC4          PC5          PC6           PC7           PC8
height      0.042047079 -0.061885367  0.1454490039 -0.1040556410 -0.980792060  0.020679696 -6.155636e-03  0.0008055445
weight      0.980711529 -0.130912788  0.1270100265  0.0193388930  0.066908382 -0.008423587  6.988341e-04  0.0036087841
forty       0.006112061  0.012525260  0.0025260713 -0.0021291637  0.004096693  0.152469227 -2.539868e-01 -0.9549983725
vertical   -0.062926466 -0.333556369  0.0398922845  0.9366594549 -0.074901137  0.012214516  7.045063e-03 -0.0070051256
bench       0.088291423 -0.313533433 -0.9363461471 -0.0745692157 -0.107188391  0.009167322 -8.604309e-05 -0.0048308793
broad_jump -0.156742686 -0.876925849  0.2904565302 -0.3252903706  0.126494599  0.013753112 -2.187651e-03 -0.0076907609
three_cone  0.007468520  0.014691994  0.0009057581  0.0003320888  0.020902644  0.894560357 -3.743559e-01  0.2427137770
shuttle     0.004518826  0.009863931  0.0023111814 -0.0094052914  0.004010629  0.419039274  8.917710e-01 -0.1700673446
Algebră liniară pentru știința datelor în R

Date NFL Combine

summary(prcomp(A))
Importance of components:
                           PC1     PC2     PC3     PC4     PC5     PC6     PC7     PC8
Standard deviation     46.7721 6.63570 4.71084 2.29502 1.64308 0.25134 0.12169 0.11434
Proportion of Variance  0.9672 0.01947 0.00981 0.00233 0.00119 0.00003 0.00001 0.00001
Cumulative Proportion   0.9672 0.98663 0.99644 0.99877 0.99996 0.99999 0.99999 1.00000
Algebră liniară pentru știința datelor în R
head(prcomp(A)$x[, 1:2])
            PC1        PC2
[1,] -62.005067  -2.654645
[2,]  48.123290   6.693433
[3,]   3.732016   1.283046
[4,] -56.823742  -9.764098
[5,]   4.213670  -3.779862
[6,]   6.924978 -15.530509
head(cbind(combine[, 1:4], prcomp(A)$x[, 1:2]))
             player position       school year        PC1        PC2
1   Jaire Alexander       CB   Louisville 2018 -62.005067  -2.654645
2       Brian Allen        C Michigan St. 2018  48.123290   6.693433
3      Mark Andrews       TE     Oklahoma 2018   3.732016   1.283046
4         Troy Apke        S     Penn St. 2018 -56.823742  -9.764098
5 Dorance Armstrong     EDGE       Kansas 2018   4.213670  -3.779862
6         Ade Aruna       DE       Tulane 2018   6.924978 -15.530509
Algebră liniară pentru știința datelor în R

Ce se poate face după ACP

  • Prelucrarea/controlul calității datelor
  • Vizualizarea datelor
  • Învățare nesupervizată (clustering)
  • Învățare supervizată (predicție sau explicație)
  • Și multe altele!
Algebră liniară pentru știința datelor în R

Exemplu - Vizualizarea datelor

Algebră liniară pentru știința datelor în R

Să exersăm!

Algebră liniară pentru știința datelor în R

Preparing Video For Download...