Vizualizarea GAM-urilor logistice

Modelare neliniară cu Generalized Additive Models (GAMs) în R

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

Transformarea scalelor

Grafice log-odds

plot(binom_mod)

Conversia efectelor parțiale

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Conversia efectelor parțiale (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Adăugarea unui intercept

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Adăugarea unui intercept (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Includerea incertitudinii interceptului

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE)

Îmbunătățirea graficului

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE, 
     shade.col = "lightgreen", col = "purple")

Să exersăm!

Modelare neliniară cu Generalized Additive Models (GAMs) în R