Randomizări de rețele

Analiza rețelelor în R

James Curley

Associate Professor, University of Texas at Austin

Grafuri aleatoare

erdos.renyi.game(n = gorder(g), p.or.m = edge_density(g), type = "gnp")

Grafuri aleatoare și teste de randomizare

Generați 1000 de grafuri aleatoare pe baza rețelei originale - ex. cu același număr de noduri și densitate aproximativă.
Calculați lungimea medie a căii în rețeaua originală.
Calculați lungimea medie a căii în cele 1000 de rețele aleatoare.
Determinați câte rețele aleatoare au o lungime medie a căii mai mare sau mai mică decât cea a rețelei originale.

Generați 1000 de grafuri aleatoare:

gl <- vector('list',1000)

for(i in 1:1000){
    gl[[i]] <- erdos.renyi.game(
                    n = gorder(g), 
                    p.or.m = edge_density(g), 
                    type = "gnp"
                     ) 
}

Calculați lungimea medie a căii pentru 1000 de grafuri aleatoare:

gl.apls <- unlist(
  lapply(gl, mean_distance, directed = FALSE) 
)

Comparație cu rețeaua originală

hist(gl.apls, breaks = 20)

abline(
  v = mean_distance(
    g, directed=FALSE
    ),
      col = "red", 
      lty = 3, 
      lwd = 2
)

Să exersăm!

Analiza rețelelor în R