Analiza expresiei diferențiale

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

John Blischak

Instructor

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Care este scopul analizei expresiei diferențiale?

  • Identificarea genelor asociate cu un fenotip de interes
  • Exemple:
    • Răspunsul la un stimul, cum ar fi un medicament
    • Modificări în timpul dezvoltării
    • Efectul unei mutații genetice
Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

De ce expresie diferențială?

  • Noutate

    • Există gene suplimentare de interes?

  • Context

    • Măsurătoarea pentru o genă este unică sau comună?

  • Sisteme

    • Ce căi biologice sunt importante?
Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Mulți pași pentru finalizarea unui experiment

  • Proiectarea studiului
  • Realizarea experimentului
  • Colectarea datelor
  • Pre-procesarea datelor
  • Explorarea datelor
  • Testarea datelor
  • Interpretarea rezultatelor
  • Comunicarea rezultatelor
Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Avertismente

  • Măsurătorile sunt relative, nu absolute

  • Metodele statistice nu pot salva un studiu prost conceput

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Să exersăm!

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Preparing Video For Download...