Teste de ipoteză

Studii de caz în gândirea statistică

Justin Bois

Lecturer, Caltech

Efectele mutației asupra activității

1 Date oferite de Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou și David Prober, Caltech
Studii de caz în gândirea statistică

Definiții ale genotipurilor

  • Tip sălbatic: Fără mutații

  • Heterozigot: Mutație pe unul din două cromozomi

  • Mutant: Mutație pe ambii cromozomi
Studii de caz în gândirea statistică

Efectele mutației asupra activității

1 Date oferite de Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou și David Prober, Caltech
Studii de caz în gândirea statistică

Efectele mutației asupra activității

1 Date oferite de Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou și David Prober, Caltech
Studii de caz în gândirea statistică

Test de ipoteză

Evaluarea măsurii în care datele observate sunt rezonabile, presupunând că o ipoteză este adevărată

Studii de caz în gândirea statistică

Valoarea p

Probabilitatea de a obține o valoare a statisticii de test cel puțin la fel de extremă ca cea observată, presupunând că ipoteza nulă este adevărată

Studii de caz în gândirea statistică

Statistica de test

  • Un număr unic calculabil din datele observate și din datele simulate sub ipoteza nulă

  • Servește ca bază de comparație
Studii de caz în gândirea statistică

Valoarea p

Probabilitatea de a obține o valoare a statisticii de test cel puțin la fel de extremă ca cea observată, presupunând că ipoteza nulă este adevărată

Necesită specificarea clară a:

  • Ipotezei nule care poate fi simulată
  • Statisticii de test calculabile din datele observate și simulate
  • Definiției expresiei cel puțin la fel de extremă
Studii de caz în gândirea statistică

Procesul de testare a ipotezelor

  • Formulați clar ipoteza nulă
  • Definiți statistica de test
  • Generați multe seturi de date simulate sub ipoteza nulă
  • Calculați statistica de test pentru fiecare set simulat
  • Valoarea p este fracția seturilor simulate pentru care statistica de test este cel puțin la fel de extremă ca pentru datele reale
Studii de caz în gândirea statistică

Specificarea testului

Ipoteza nulă: lungimile episoadelor active ale peștilor de tip sălbatic și heterozigot sunt distribuite identic

Statistica de test: Diferența dintre mediile lungimilor episoadelor active la heterozigote și tipul sălbatic

Cel puțin la fel de extremă: Statistica de test este mai mare sau egală cu cea observată

Studii de caz în gândirea statistică

Test de permutare

Pentru fiecare replicare:

  • Amestecați etichetele punctelor de date
  • Calculați statistica de test
perm_reps = dcst.draw_perm_reps(
    data_a, data_b, dcst.diff_of_means, size=10000
)

Valoarea p este fracția replicărilor cel puțin la fel de extreme ca cea observată

p_val = np.sum(perm_reps >= diff_means_obs) / len(perm_reps)
Studii de caz în gândirea statistică

Să exersăm!

Studii de caz în gândirea statistică

Preparing Video For Download...