Альтернативы диаграмме «ящик с усами»

Лучшие практики визуализации в R

Nick Strayer

Instructor

Ограничения диаграммы «ящик с усами» с джиттером

• Случайное смещение точек справляется лишь с небольшим перекрытием
• Плотность данных трудно оценить

Какие ещё есть варианты?

Диаграммы пчелиного роя

Скрипичные диаграммы

Диаграммы пчелиного роя

• «Умный» джиттер
• Точки располагаются как можно ближе к оси
• Реализован в функции geom_beeswarm() из пакета ggbeeswarm

library(ggbeeswarm)
ggplot(data, aes(y = y, x =  group)) + 
  geom_beeswarm(color = 'steelblue')

Преимущества диаграмм пчелиного роя

• Отдельные точки данных
• Форма распределения

Недостатки диаграмм пчелиного роя

• Сложно применять при больших объёмах данных
• Произвольное расположение точек

Скрипичные диаграммы

• Ядерная оценка плотности (KDE) отражается симметрично
• Просто замените geom_boxplot() на geom_violin()

ggplot(data, aes(y = y, x = group)) + 
  geom_violin(fill = 'steelblue') 

Преимущества скрипичных диаграмм

• Учитывается каждая точка данных
• Отдельные точки не отображаются — подходит для больших объёмов данных

Недостатки скрипичных диаграмм

• Выбор ширины ядра
• Отдельные точки не отображаются

Давайте потренируемся!

Лучшие практики визуализации в R