Нормализация счётчиков
RNA-Seq с Bioconductor в R
Mary Piper
Bioinformatics Consultant and Trainer
Нормализация счётчиков
Нормализация по глубине библиотеки
Влияние состава библиотеки
Нормализация в DESeq2
Нормализованные счётчики: вычисление
dds_wt <- estimateSizeFactors(dds_wt)sizeFactors(dds_wt)
Нормализованные счётчики: извлечение
normalized_wt_counts <- counts(dds_wt, normalized=TRUE)View(normalized_wt_counts)
