Визуализация логистических GAM

Нелинейное моделирование с помощью обобщённых аддитивных моделей (GAM) в R

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

Преобразование шкал

Графики логарифмических шансов

plot(binom_mod)

Преобразование частичных эффектов

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Преобразование частичных эффектов (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Добавление свободного члена

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Добавление свободного члена (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Учёт неопределённости свободного члена

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE)

Улучшение графика

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE, 
     shade.col = "lightgreen", col = "purple")

Давайте потренируемся!

Нелинейное моделирование с помощью обобщённых аддитивных моделей (GAM) в R