Модель Вейбулла для оценки гладких кривых выживаемости

Анализ выживаемости в R

Heidi Seibold

Statistician at LMU Munich

Зачем использовать модель Вейбулла?

Анализ выживаемости в R

Вычисление модели Вейбулла в R

Модель Вейбулла:

wb <- survreg(Surv(time, event) ~ 1, data)
Анализ выживаемости в R

Вычисление модели Вейбулла в R

Модель Вейбулла:

wb <- survreg(Surv(time, event) ~ 1, data)

Оценка Каплана–Мейера:

km <- survfit(Surv(time, event) ~ 1, data)
Анализ выживаемости в R

Вычисление показателей по модели Вейбулла

wb <- survreg(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)

90% пациентов выживают после момента времени:

predict(wb, type = "quantile", p = 1 - 0.9, newdata = data.frame(1))
       1 
384.9947

p = 1 - 0.9, поскольку функция распределения равна 1 минус функция выживаемости.

Анализ выживаемости в R
wb <- survreg(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)

Кривая выживаемости:

surv <- seq(.99, .01, by = -.01)

t <- predict(wb, type = "quantile", p = 1 - surv, newdata = data.frame(1)) head(data.frame(time = t, surv = surv))
       time surv
 1  60.6560 0.99
 2 105.0392 0.98
 3 145.0723 0.97
 4 182.6430 0.96
 5 218.5715 0.95
 6 253.3125 0.94
Анализ выживаемости в R

Давайте потренируемся!

Анализ выживаемости в R

Preparing Video For Download...