Оценка финальных моделей

R для пользователей SAS

Melinda Higgins, PhD

Research Professor/Senior Biostatistician Emory University

Финальные упражнения

Итоги курса

Запуск регрессионных моделей
- для разных предикторов
- для разных групп
Выбор лучших моделей
- сохранение результатов
- извлечение и отображение статистик качества

Продемонстрируйте навыки

Оценка и сравнение моделей
- с помощью графических визуализаций
Анализ наиболее значимых связей
- между переменными
- в целом и по группам

Сравнение моделей

# Run lm() for diffht by bmi, save model
lmdiffhtbmi <- lm(diffht ~ bmi,
                  data = daviskeep)

# Run lm() for diffht by weight, save model
lmdiffhtwt <- lm(diffht ~ weight,
                 data = daviskeep)

# Run summary() for each model, save results
smrylmdiffhtbmi <- summary(lmdiffhtbmi)
smrylmdiffhtwt <- summary(lmdiffhtwt)

Сравнение моделей

# Display r.squared for weight model
smrylmdiffhtwt$r.squared

# Display r.squared for bmi model
smrylmdiffhtbmi$r.squared

# Compare AICs for both models
AIC(lmdiffhtbmi, lmdiffhtwt)


[1] 0.003281645


[1] 0.00121824

            df      AIC
lmdiffhtbmi  3 788.0816
lmdiffhtwt   3 787.7052

Модели по группам: мужчины и женщины

# Plot diffht by weight by sex
ggplot(daviskeep,
       aes(diffht, weight)) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method = "lm") +
  facet_wrap(vars(sex)) +
  ggtitle("Height differences
          predicted by weight,
          model fit by sex")

график diffht по весу в разбивке по полу

Регрессия на подвыборке

опция where в sas proc reg аналогична опции subset в функции lm в R

Построение моделей для подвыборок

# lm() of diffht by weight for females
lmdiffhtwtF <- lm(diffht ~ weight,
                  subset = (sex == "F"),
                  data = daviskeep)

# lm() of diffht by weight for males
lmdiffhtwtM <- lm(diffht ~ weight,
                  subset = (sex == "M"),
                  data = daviskeep)

# Run summary() for each model save results
smrylmdiffhtwtF <- summary(lmdiffhtwtF)
smrylmdiffhtwtM <- summary(lmdiffhtwtM)

Построение моделей для подвыборок

# r.squared for females only model
smrylmdiffhtwtF$r.squared

# r.squared for males only model
smrylmdiffhtwtM$r.squared


[1] 4.00807e-05


[1] 0.00804139

Завершим курс, построив несколько моделей для предсказания возраста морских ушков!

R для пользователей SAS