Байесовское моделирование с RJAGS
Alicia Johnson
Associate Professor, Macalester College
$Y_i$ = вес взрослого $i$ (кг)
$X_i$ = рост взрослого $i$ (см)
$\;$
Модель
$Y_i \sim N(m_i, s^2)$
$m_i = a + b X_i$
$a \sim N(0, 200^2)$
$b \sim N(1, 0.5^2)$
$s \sim \text{Unif}(0, 20)$



summary(weight_sim_big)
1. Empirical mean and standard deviation for each variable,
plus standard error of the mean:
Mean SD Naive SE Time-series SE
a -104.038 7.85296 0.0248332 0.661515
b 1.012 0.04581 0.0001449 0.003849
s 9.331 0.29495 0.0009327 0.001216
2. Quantiles for each variable:
2.5% 25% 50% 75% 97.5%
a -118.6843 -109.5171 -104.365 -99.036 -87.470
b 0.9152 0.9828 1.014 1.044 1.098
s 8.7764 9.1284 9.322 9.524 9.933
Апостериорное среднее $a$ $\approx$ -104.038
Апостериорное среднее $b$ $\approx$ 1.012

Апостериорный средний тренд:
$m_i = -104.038 + 1.012 X_i$
Вывод цепи Маркова:
head(weight_chains)
a b s
[1,] -113.9029 1.072505 8.772007
[2,] -115.0644 1.077914 8.986393
[3,] -114.6958 1.077130 9.679812
[4,] -115.0568 1.072668 8.814403
[5,] -114.0782 1.071775 8.895299
[6,] -114.3271 1.069477 9.016185

Апостериорный средний тренд:
$m_i = -104.038 + 1.012 X_i$
Вывод цепи Маркова:
head(weight_chains)
a b s
[1,] -113.9029 1.072505 8.772007
[2,] -115.0644 1.077914 8.986393
[3,] -114.6958 1.077130 9.679812
[4,] -115.0568 1.072668 8.814403
[5,] -114.0782 1.071775 8.895299
[6,] -114.3271 1.069477 9.016185

summary(weight_sim_big)
1. Empirical mean and standard deviation for each variable,
plus standard error of the mean:
Mean SD Naive SE Time-series SE
a -104.038 7.85296 0.0248332 0.661515
b 1.012 0.04581 0.0001449 0.003849
s 9.331 0.29495 0.0009327 0.001216
2. Quantiles for each variable:
2.5% 25% 50% 75% 97.5%
a -118.6843 -109.5171 -104.365 -99.036 -87.470
b 0.9152 0.9828 1.014 1.044 1.098
s 8.7764 9.1284 9.322 9.524 9.933
95% апостериорный доверительный интервал для $a$: (-118.6843, -87.470)
95% апостериорный доверительный интервал для $b$: (0.9152, 1.098)

Интерпретация
С учётом априорных распределений и наблюдаемых данных, с апостериорной вероятностью 95% значение $b$ находится в диапазоне от 0,9152 до 1,098 кг/см.

table(weight_chains$b > 1.1)
FALSE TRUE
97835 2165
mean(weight_chains$b > 1.1)
0.02165
Интерпретация:
Апостериорная вероятность того, что $b$ превышает 1,1 кг/см, составляет 2,165%.
Байесовское моделирование с RJAGS