Ссылки и копии
Масштабируемая обработка данных в R
Simon Urbanek
Member of R-Core, Lead Inventive Scientist, AT&T Labs Research
Большие матрицы и матрицы — сходства
- Срез
- Присваивание
Большие матрицы и матрицы — различия
big.matrixхранится на диске- Сохраняется между сессиями R
- Может использоваться совместно в разных сессиях R
R обычно создаёт копии при присваивании
Создаётся копия a, которая присваивается b.
a <- 42
b <- a
a
42
b
42
a <- 43
a
43
b
42
R обычно создаёт копии при присваивании
a <- 42foo <- function(a){a <- 43 paste("Inside the function a is", a)}
foo(a)
"Inside the function a is 43"
paste("Outside the function a is still", a)
"Outside the function a is still 42"
Не все объекты R копируются
Эта функция изменяет значение a в глобальном окружении
foo <- function(a) {a$val <- 43
paste("Inside the function a is", a$val)}
a <- environment()
a$val <- 42
foo(a)
"Inside the function a is 43"
paste("Outside the function a$val is", a$val)
"Outside the function a$val is 43"
deepcopy()
# x is a big matrix
x <- big.matrix(...)
# x_no_copy and x refer to the same object
x_no_copy <- x
# x_copy and x refer to different objects
x_copy <- deepcopy(x)
Ссылочное поведение
R не создаёт копии неявно
- Минимальное использование памяти
- Сокращение времени выполнения
Не все объекты R копируются
library(bigmemory)
x <- big.matrix(nrow = 1, ncol = 3, type = "double",
init = 0,
backingfile = "hello-bigmemory.bin",
descriptorfile = "hello-bigmemory.desc")
Не все объекты R копируются
x_no_copy <- x
x[,]
0 0 0
x_no_copy[,]
0 0 0
x[,] <- 1
x[,]
1 1 1
x_no_copy[,]
1 1 1
Не все объекты R копируются
x_copy <- deepcopy(x)
x[,]
1 1 1
x_copy[,]
1 1 1
x[,] <- 2
x[,]
2 2 2
x_copy[,]
1 1 1
Давайте потренируемся!
Масштабируемая обработка данных в R
