Cours éclair sur les GLM

Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

Richard Erickson

Data Scientist

Hypothèse de normalité

  • Résidus « normaux »
  • Transformation
  • « L'arcsine est absurde… »
  • Distributions de rechange
Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

Syntaxe R pour les GLM

glm(y ~ x, family = "gaussian")
?family
Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

Exemple de tracé d'une distribution de Poisson avec lambda égal à 3

Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

Exemple avec une régression de Poisson

glm(y ~ x, family = "poisson")
Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

Exemple de tracé d'une régression logistique.

Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

Exemple avec une régression logistique

# binaire : y = 0 ou 1
glm(y ~ x, family = "binomial")

# Wilkinson-Rogers : cbind(success, failure) glm(cbind(success, failure) ~ x, family = "binomial")
# Format pondéré : y = 0.3, weights = 10 glm(y ~ x, weights = weights, family = "binomial")
Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

Passons à la pratique !

Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

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