Autres options que le boxplot

Les meilleures pratiques de visualisation avec R

Nick Strayer

Instructor

Limites du boxplot avec jitter

• Le « jitter » gère mal les forts chevauchements
• Difficile d'évaluer la densité des données

Quelles autres options ?

Graphiques en essaim d'abeilles

Graphiques en violon

Graphiques en essaim d'abeilles

• Jitter « intelligent »
• Points regroupés au plus près de l'axe
• Intégré via geom_beeswarm() dans le paquet ggbeeswarm.

library(ggbeeswarm)
ggplot(data, aes(y = y, x =  group)) + 
  geom_beeswarm(color = 'steelblue')

Atouts de l'essaim d'abeilles

• Points individuels
• Forme de la distribution

Limites de l'essaim d'abeilles

• Difficile avec beaucoup de données
• Empilement arbitraire

Graphiques en violon

• KDE réfléchi pour être symétrique
• Remplacez geom_boxplot() par geom_violin().

ggplot(data, aes(y = y, x = group)) + 
  geom_violin(fill = 'steelblue') 

Atouts du violon

• Chaque point compte
• Tous les points ne sont pas visibles : adapté aux grands volumes

Limites du violon

• Choix de la largeur du noyau
• Tous les points ne sont pas visibles

Essayons des comparaisons plus avancées !

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