Choisir le nombre de grappes

Apprentissage non supervisé en R

Hank Roark

Senior Data Scientist at Boeing

Interpréter les résultats

# Create hierarchical cluster model: hclust.out
hclust.out <- hclust(dist(x))

# Inspect the result
summary(hclust.out)

            Length Class  Mode     
merge       98     -none- numeric  
height      49     -none- numeric  
order       50     -none- numeric  
labels       0     -none- NULL     
method       1     -none- character
call         2     -none- call     
dist.method  1     -none- character

Dendrogramme

Structure en arbre pour interpréter les modèles de groupement hiérarchique

cinq observations tracées et un dendrogramme

Dendrogramme

Structure en arbre pour interpréter les modèles de groupement hiérarchique

deux points de grappe sont réunis dans le dendrogramme

Dendrogramme

Structure en arbre pour interpréter les modèles de groupement hiérarchique

deux autres points de grappe sont réunis dans le dendrogramme

Dendrogramme

Structure en arbre pour interpréter les modèles de groupement hiérarchique

deux grappes et un point sont réunis dans le dendrogramme

Dendrogramme

Structure en arbre pour interpréter les modèles de groupement hiérarchique

toutes les grappes et tous les points sont réunis dans le dendrogramme

Tracer un dendrogramme en R

# Draws a dendrogram
plot(hclust.out)

abline(h = 6, col = "red")

barre horizontale indiquant le nombre de grappes voulu sur le dendrogramme

« Couper » l'arbre en R

# Cut by height h
cutree(hclust.out, h = 6)

1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 3
3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 2 4 2 4 4

# Cut by number of clusters k
cutree(hclust.out, k = 2)

1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2
2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1

Passons à la pratique !

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