Fonctions de base de lm() avec glm()

Modèles linéaires généralisés (GLM) en R

Richard Erickson

Instructor

Interaction avec les objets de modèle

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Fonctions de base R applicables à glm()
Raccourcis utiles

Affichage du modèle

print() est souvent l'option par défaut

print(poisson_out)

Call:  glm(formula = y ~ x, family = "poisson", data = dat)

Coefficients:
(Intercept)            x  
   -1.43036      0.05815  

Degrees of Freedom: 29 Total (i.e. Null);  28 Residual
Null Deviance:        35.63 
Residual Deviance: 30.92     AIC: 66.02

Résumé du modèle

summary() donne plus de détails

summary(poisson_out)

#...
Deviance Residuals: 
    Min       1Q   Median       3Q      Max  
-1.6547  -0.9666  -0.7226   0.3830   2.3022

Coefficients:
            Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)  
(Intercept) -1.43036    0.59004  -2.424   0.0153 *
x            0.05815    0.02779   2.093   0.0364 *

Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

(Dispersion parameter for poisson family taken to be 1)

    Null deviance: 35.627  on 29  degrees of freedom
Residual deviance: 30.918  on 28  degrees of freedom
AIC: 66.024

Number of Fisher Scoring iterations: 5

Sortie « tidy »

Le Tidyverse fournit des sorties de modèle normalisées
tidy() du forfait Broom

library(broom)
tidy(poisson_out)

         term    estimate  std.error statistic    p.value
1 (Intercept) -1.43035579 0.59003923 -2.424171 0.01534339
2           x  0.05814858 0.02778801  2.092578 0.03638686

Coefficients de régression

coef() affiche les coefficients de régression

coef(poisson_out)

(Intercept)           x 
-1.43035579  0.05814858

Intervalles de confiance

confint() estime les intervalles de confiance

confint(poisson_out)

Waiting for profiling to be done...
               2.5 %     97.5 %
(Intercept) -2.725545344 -0.3897748
x            0.005500767  0.1155564

Prédictions

predict(model, new_data)
Argument new_data :
- Non précisé : predict() renvoie des prédictions à partir des données d'ajustement.
- Précisé : predict() renvoie des prédictions pour new_data.

Ensemble sur les blessures liées aux incendies

Blessures quotidiennes chez les civils
Louisville (KY)
Données de comptage, plusieurs zéros

Blessures quotidiennes causées par des incendies à Louisville (KY)

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