Session R = environnement + packages

R pour les utilisateurs et utilisatrices de SAS

Melinda Higgins, PhD

Research Professor/Senior Biostatistician Emory University

Pourquoi apprendre R ?

R est GRATUIT. Gratuit en coût et en licence libre
La popularité de R croît rapidement $^1$
- Les emplois en science des données pour R dépassent désormais ceux pour SAS
- R est maintenant plus souvent cité dans les articles scientifiques que SAS
L'installation de base de R est légère (généralement <100 Mo)
Ai-je mentionné que R est GRATUIT ?

¹ [https://r4stats.com/articles/popularity/](https://r4stats.com/articles/popularity/)

Une session de calcul : SAS vs R

composants de SAS

Une session de calcul : SAS vs R

ajouter la bibliothèque de travail SAS

Une session de calcul : SAS vs R

packages R

Une session de calcul : SAS vs R

ajouter l'environnement global R

Une session de calcul : SAS vs R

lien fléché entre composants SAS et packages R

Une session de calcul : SAS vs R

lien fléché entre la bibliothèque de travail SAS et l'environnement global R

Données et autres objets

proc datasets de SAS comme la fonction r ls list

ls() dresse la liste de toutes les données et objets de l'environnement global de la session R

Charger des fichiers de données

sas libname ou data et set comme la fonction r load

load() charge des ensembles de données au format binaire .RData

Environnement global – nouvelle session

Au début d'une nouvelle session R, l'environnement global est généralement vide.

ls()

character(0)

Charger des données

Ensemble de données Abalone $^1$
Mollusque bivalve, proche des palourdes, moules ou huîtres
Marine Research Lab, Tasmanie, Australie
Utiliser des mesures pour prédire l'âge

# Charger l'ensemble de données abalone
load("abalone.RData")

# Lister les objets en mémoire
ls()

"abalone"

photo d'un ormeau

¹ [https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/abalone](https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/abalone)

Obtenir de l'aide

menu d'aide SAS comme la fonction r help

help() donne accès à la documentation de toute fonction ou de tout package installé

help(ls)

capture d'écran de la page d'aide de la fonction r ls list

Paramètres et fonctionnalités

procédures sas setinit et product status comme les fonctions r sessioninfo et library

sessioninfo() fournit des détails sur le système et les packages chargés
library() sert à charger des packages durant votre session R
Des dizaines de milliers de packages R sont offerts, et ce nombre augmente chaque jour $^1$

¹ [https://cran.r-project.org/web/packages/](https://cran.r-project.org/web/packages/)

R sessionInfo

sessionInfo()

R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United States.1252

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base

R sessionInfo

# Charger le package dplyr et relancer sessionInfo
library(dplyr)
sessionInfo()

R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

... some output removed ...

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base   

other attached base packages:
[1] dplyr_0.7.7

Commencez votre première session R

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