Concept de projection

Analyse de réseaux intermédiaire en Python

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

Projection

  • Utile pour analyser les relations entre les nœuds d'une partition
    • En fonction des liens avec les nœuds de l'autre partition
Analyse de réseaux intermédiaire en Python

Projection

  • Représentation unipartite d'une connectivité bipartite

ch2-1.006.png

Analyse de réseaux intermédiaire en Python

Projection

  • Représentation unipartite d'une connectivité bipartite

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Projection

  • Représentation unipartite d'une connectivité bipartite

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Analyse de réseaux intermédiaire en Python

Projection

  • Représentation unipartite d'une connectivité bipartite

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Graphes sur disque

  • Listes d'arêtes à plat
  • Fichiers CSV : liste des nœuds + métadonnées, liste des arêtes + métadonnées
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Lecture de données de réseau

import networkx as nx
G = nx.read_edgelist('american-revolution.txt')

list(G.edges(data=True))[0:5]
[('Parkman.Elias', 'LondonEnemies', {'weight': 1}),
 ('Parkman.Elias', 'NorthCaucus', {'weight': 1}),
 ('Inglish.Alexander', 'StAndrewsLodge', {'weight': 1}),
 ('NorthCaucus', 'Chadwell.Mr', {'weight': 1}),
 ('NorthCaucus', 'Pearce.IsaacJun', {'weight': 1})]
  • Fichier texte
    Barrett.Samuel LondonEnemies {'weight': 1}
    Barrett.Samuel StAndrewsLodge {'weight': 1}
    Marshall.Thomas LondonEnemies {'weight': 1}
    Eaton.Joseph TeaParty {'weight': 1}
    Bass.Henry LondonEnemies {'weight': 1}
    
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Projection bipartite

list(G.nodes())
['product2', 'customer3', 'customer1', 'product3',  
    'customer2', 'product1']
list(G.edges())
[('product2', 'customer1'),
 ('product2', 'customer2'),
 ('customer3', 'product1')]
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Projection bipartite

cust_nodes = [n for n in G.nodes() if G.nodes[n]
                  ['bipartite'] == 'customers']
cust_nodes
['customer3', 'customer1', 'customer2']
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Projection bipartite

G_cust = nx.bipartite.projected_graph(G, cust_nodes)
list(G_cust.nodes())
['customer1', 'customer3', 'customer2']
list(G_cust.edges())
[('customer1', 'customer2')]
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Centralité de degré

  • Rappel : centralité de degré $$\frac{\text{nombre de voisins}}{\text{nombre de voisins possibles}}$$
  • Dénominateur : nombre de nœuds sur la partition opposée
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Centralité de degré bipartite

nx.bipartite.degree_centrality(G, cust_nodes)
{'customer1': 0.3333333333333333,
 'customer2': 0.3333333333333333,
 'customer3': 0.3333333333333333,
 'product1': 0.3333333333333333,
 'product2': 0.6666666666666666,
 'product3': 0.0}
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Centralité de degré bipartite

nx.degree_centrality(G)
{'customer1': 0.2,
 'customer2': 0.2,
 'customer3': 0.2,
 'product1': 0.2,
 'product2': 0.4,
 'product3': 0.0}
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Passons à la pratique !

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