La commande plot

Modélisation non linéaire avec les Generalized Additive Models (GAM) en R

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

La commande plot

plot(gam_model)

?plot.gam

Sélectionner des effets partiels

plot(gam_model, select = c(2, 3))
plot(gam_model, pages = 1)
plot(gam_model, pages = 1, all.terms = TRUE)

Afficher les données sur les graphiques

plot(gam_model, rug = TRUE)

Afficher les données sur les graphiques (2)

plot(gam_model, residuals = TRUE)

Afficher les données sur les graphiques (3)

plot(gam_model, rug = TRUE, residuals = TRUE,
     pch = 1, cex = 1)

Afficher les erreurs types

plot(gam_model, se = TRUE)

Afficher les erreurs types (2)

plot(gam_model, shade = TRUE)

Afficher les erreurs types

plot(gam_model, shade = TRUE, shade.col = "lightblue")

Transformer les erreurs types

plot(gam_model, seWithMean = TRUE)

Transformer les erreurs types (2)

plot(gam_model, seWithMean = TRUE, shift = coef(gam_model)[1])

Passons à la pratique !

Modélisation non linéaire avec les Generalized Additive Models (GAM) en R