Test exact de Fisher

Tests A/B en R

Lauryn Burleigh

Data Scientist

Spécifications

  • Non paramétrique pour données catégorielles
    • Re-manger de la pizza Fromage ou Pepperoni
  • Échantillon < 1000
  • Fréquence < 5 pour au moins 20 %
  • Utilisez le test exact de Fisher pour une p-valeur exacte
  • Tableau de contingence 2x2

Loi hypergéométrique

  • Vraisemblance du tableau de fréquences
table(Pizza$Topping, Pizza$EatAgain)
              No Yes
  Cheese     140 360
  Pepperoni   80 420
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Hypothèses

  • Hypothèse nulle : aucun lien entre remanger de la pizza et le groupe de garniture

Photo de pointes de pizza prises par plusieurs mains.

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Échantillon

library(pwr)
pwr.chisq.test(w = 0.1, df = 2, 
               power = 0.80, 
               sig.level = 0.05)
     Chi squared power calculation 
              w = 0.1
              N = 963.4689
             df = 2
      sig.level = 0.05
          power = 0.8
NOTE: N is the number of observations
table(Pizza$Topping, Pizza$EatAgain)
              No Yes
  Cheese     140 360
  Pepperoni   80 420
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Test

freqtbl <- table(Pizza$Topping, 
                 Pizza$Time)
fisher.test(freqtbl) 
    Fisher's Exact Test for Count Data
data:  freqtbl
p-value = 0.001809
alternative hypothesis: true odds ratio is not equal to 1
95 percent confidence interval:
 0.4569013 0.8417208
sample estimates:
odds ratio 
 0.6209987 
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Taille d'effet

freqtbl <- table(Pizza$Topping, 
                 Pizza$Time)
fisher.test(freqtbl) 
  • Petite : 1,5
  • Moyenne : 2,5
  • Grande : 4
  • Pizza Pepperoni × 0,62 que pizza Fromage
Fisher's Exact Test for Count Data
data:  freqtbl
p-value = 0.001809
alternative hypothesis: true odds 
ratio is not equal to 1
95 percent confidence interval:
 0.4569013 0.8417208
sample estimates:
odds ratio 
 0.6209987  
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Puissance

library(pwr)
pwr.2p.test(h = 0.62, n = 500, 
            sig.level = 0.002) 
    Difference of proportion power 
 calculation for binomial distribution

              h = 0.62
              n = 500
      sig.level = 0.002
          power = 1
    alternative = two.sided

NOTE: same sample sizes
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Passons à la pratique !

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