t-distributed Stochastic Neighbor Embedding (t-SNE)

Réduction de dimension en R

Matt Pickard

Owner, Pickard Predictives, LLC

Tableau t-SNE vs ACP

Tracer l'ACP et t-SNE

ACP

Graphique ACP

Préserve la structure globale

t-SNE

Graphique t-SNE

Préserve la structure locale (garde les voisins ensemble)

Hyperparamètres de t-SNE

Perplexité – fixe le nombre de plus proches voisins pris en compte
Taux d'apprentissage – rythme d'ajustement des poids du réseau de neurones
Itérations – nombre d'itérations de rétropropagation

t-SNE

Graphique t-SNE

t-SNE en R

library(Rtsne)


set.seed(1234)
tsne <- Rtsne(attrition_df %>% select(-Attrition))


tsne_df <- attrition_df %>% 
  bind_cols(tsne_x = tsne$Y[,1], tsne_y = tsne$Y[,2])


tsne_df %>% 
  ggplot(aes(x = tsne_x, y = tsne_y, color = Attrition)) +
  geom_point(alpha = 0.5)

Graphique t-SNE

Passons à la pratique !

Réduction de dimension en R