Créer des vecteurs

Optimiser le code R avec Rcpp

Romain François

Consulting Datactive, ThinkR

Obtenir un vecteur côté R

Code C++

// [[Rcpp::export]]
double extract( NumericVector x, int i){
    return x[i] ;}

Appel depuis R

x <- c(13.2, 34.1)
extract(x, 0)

x[1]

13.2

13.2

// [[Rcpp::export]]
double extract( NumericVector x, int i){
    return x[i] ;}

Plusieurs cas

# x est déjà un vecteur numérique
extract( c(13.3, 54.2), 0 )

13.3

# x est un vecteur d'entiers; il est d'abord converti en vecteur numérique
extract( 1:10, 0 )

// [[Rcpp::export]]
double extract( NumericVector x, int i){
    return x[i] ;}

# conversion impossible : erreur
extract( letters, 0 )

Error in extract(letters, 0) : 
  Not compatible with requested type: [type=character; target=double].

Créer un vecteur d'une taille donnée

// [[Rcpp::export]]
NumericVector ones(int n){
    // créer un nouveau vecteur numérique de taille n
    NumericVector x(n) ;    
    // le modifier
    for( int i=0; i<n; i++){
        x[i] = 1 ; }
    return x ;
}

Appel de ones depuis R :

ones(10)

1 1 1 1 1 1 1 1 1 1

Variantes de constructeur

double value = 42.0 ;
int n = 20 ;

// créer un vecteur numérique de taille 20 
// avec toutes les valeurs à 42
NumericVector x( n, value ) ;

Ensemble de valeurs donné

NumericVector x = NumericVector::create( 1, 2, 3 );

CharacterVector s = CharacterVector::create( "pink", "blue" );

Ensemble de valeurs nommé

Nommer toutes les valeurs

NumericVector x = NumericVector::create( 
    _["a"] = 1, _["b"] = 2, _["c"] = 3
) ;

Ne nommer que certaines valeurs

IntegerVector y = IntegerVector::create( 
    _["d"] = 4, 5, 6, _["f"] = 7
) ;

Clonage de vecteur

// [[Rcpp::export]]
NumericVector positives( NumericVector x ){

    // cloner x dans y
    NumericVector y = clone(x) ;

    for( int i=0; i< y.size(); i++){
        if( y[i] < 0 ) y[i] = 0 ;
    }
    return y ;
}

Passons à la pratique !

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