Conclusion

Modélisation bayésienne avec RJAGS

Alicia Johnson

Associate Professor, Macalester College

Modélisation bayésienne avec RJAGS

  • Définir, compiler et simuler des modèles bayésiens difficiles à résoudre.
  • Explorer la mécanique des chaînes de Markov derrière la simulation RJAGS.

Modélisation bayésienne avec RJAGS

La force de la modélisation bayésienne

  • Combiner les enseignements de vos données et des a priori pour éclairer l'a posteriori.

Modélisation bayésienne avec RJAGS

La force de la modélisation bayésienne

  • Combiner les enseignements de vos données et des a priori pour éclairer l'a posteriori.
  • Mener une inférence a posteriori intuitive : intervalles crédibles et probabilités a posteriori.

Modélisation bayésienne avec RJAGS

Modèles bayésiens fondamentaux, flexibles et généralisables

my_model <- "model{
  # Likelihood model
  for(i in 1:length(Y)) {
    Y[i] ~ dnorm(m, s^(-2))
  }

  # Prior models
  m ~ dnorm(...)
  s ~ dunif(...)
}"

Modélisation bayésienne avec RJAGS

Modèles bayésiens fondamentaux, flexibles et généralisables

my_model <- "model{
  # Likelihood model
  for(i in 1:length(Y)) {
    Y[i] ~ dnorm(m[i], s^(-2))
    m[i] <- a + b * X[i]
  }

  # Prior models
  a ~ dnorm(...)
  b ~ dnorm(...)
  s ~ dunif(...)
}"

Modélisation bayésienne avec RJAGS

Modèles bayésiens fondamentaux, flexibles et généralisables

my_model <- "model{
  # Likelihood model
  for(i in 1:length(Y)) {
    Y[i] ~ dnorm(m[i], s^(-2))
    m[i] <- a + b[X[i]]
  }

  # Prior models
  a ~ dnorm(...)
  b[1] <- 0
  b[2] ~ dnorm(...)
  s ~ dunif(...)
}"

Modélisation bayésienne avec RJAGS

Modèles bayésiens fondamentaux, flexibles et généralisables

my_model <- "model{
  # Likelihood model
  for(i in 1:length(Y)) {
    Y[i] ~ dnorm(m[i], s^(-2))
    m[i] <- a + b[X[i]] + c * Z[i]
  }
  # Prior models
  a ~ dnorm(...)
  b[1] <- 0
  b[2] ~ dnorm(...)
  c ~ dnorm(...)
  s ~ dunif(...)
}"

Modélisation bayésienne avec RJAGS

Modèles bayésiens fondamentaux, flexibles et généralisables

my_model <- "model{
 # Likelihood model
 for(i in 1:length(Y)) {
 Y[i] ~ dpois(l[i])
 log(l[i]) <- a + b[X[i]] + c*Z[i]
 }
 # Prior models
 a ~ dnorm(...)
 b[1] <- 0
 b[2] ~ dnorm(...)
 c ~ dnorm(...)
}"

Modélisation bayésienne avec RJAGS

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Modélisation bayésienne avec RJAGS

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