The Bioconductor Project

Bioconductor เบื้องต้นใน R

James Chapman

Curriculum Manager, DataCamp

Bioconductor

Bioconductor

1 Bioconductor (www.bioconductor.org)
Bioconductor เบื้องต้นใน R

วัดอะไรและทำไม?

  • โครงสร้าง: องค์ประกอบ, บริเวณ, ขนาด, ลำดับ, ความสัมพันธ์

structure-parts

  • ฟังก์ชัน: การแสดงออก, ระดับ, การควบคุม, ฟีโนไทป์

function

Bioconductor เบื้องต้นใน R

ติดตั้งแพ็กเกจ Bioconductor อย่างไร?

  • Bioconductor มี repository และวิธีติดตั้งแพ็กเกจเป็นของตัวเอง
# Install BiocManager
install.packages("BiocManager")

# Install the GenomicRanges package
BiocManager::install("GenomicRanges")
Bioconductor เบื้องต้นใน R

เวอร์ชันของ Bioconductor และแพ็กเกจ

# Load BiocManager
library(BiocManager)


# Check Bioconductor version
version()
Bioconductor เบื้องต้นใน R

ตรวจสอบเวอร์ชันของแพ็กเกจ

# Load GenomicRanges
library(GenomicRanges)


# Check versions for reproducibility
sessionInfo()
Bioconductor เบื้องต้นใน R

การอัปเดตแพ็กเกจ

# Check for package updates
valid()
Bioconductor เบื้องต้นใน R

มาฝึกกันเถอะ!

Bioconductor เบื้องต้นใน R

Preparing Video For Download...