การ Normalize จำนวน Read

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

การ Normalize จำนวน Read

การ Normalize ตามความลึกของ Library

ผลขององค์ประกอบ Library

การ Normalize ด้วย DESeq2

Normalized Counts: การคำนวณ

dds_wt <- estimateSizeFactors(dds_wt)

sizeFactors(dds_wt)

Normalized Counts: การดึงข้อมูล

normalized_wt_counts <- counts(dds_wt, normalized=TRUE)

View(normalized_wt_counts)

มาฝึกกันเถอะ!

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R