การวิเคราะห์การแสดงออกเชิงอนุพันธ์

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

DESeq2

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การวิเคราะห์การแสดงออกเชิงอนุพันธ์: DESeq2 vignette

vignette(DESeq2)

DESeq2 vignette

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การสำรวจ vignette

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

ขั้นตอนการทำงานของ DESeq2

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การนำเข้าข้อมูลสำหรับ DESeq2

# Read in raw counts
wt_rawcounts <- read.csv("fibrosis_wt_rawcounts.csv") 
View(wt_rawcounts)

จำนวนนับดิบของ fibrosis wt

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การนำเข้าข้อมูลสำหรับ DESeq2: เมทาดาทา

# Read in metadata
wt_metadata <- read.csv("fibrosis_wt_metadata_unordered.csv") 
View(wt_metadata)

เมทาดาทาของ fibrosis wt

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

มาฝึกกันเถอะ!

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

Preparing Video For Download...