สรุปการวิเคราะห์ DE ด้วย RNA-Seq

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

workflow

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การเตรียม RNA-Seq

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

QC

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

ขั้นตอน RNA-Seq: การควบคุมคุณภาพข้อมูลดิบ

การปนเปื้อนของลำดับ

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การจัดเรียง

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

ขั้นตอน RNA-Seq: การจัดเรียงลำดับ

การจัดเรียง2

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การวัดปริมาณ

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

ขั้นตอน RNA-Seq: การวัดปริมาณ

จำนวนรีด

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

ขั้นตอนทั้งหมด

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

การเตรียมวิเคราะห์การแสดงออกเชิงอนุพันธ์: DESeq2 object

dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = rawcounts,
                        colData = metadata,
                        design = ~ condition)

ข้อมูลจำนวนรีด

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

มาฝึกกันเถอะ!

RNA-Seq ด้วย Bioconductor ใน R

Preparing Video For Download...