Аналіз диференційної експресії

RNA-Seq з Bioconductor у R

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

DESeq2

RNA-Seq з Bioconductor у R

Аналіз диференційної експресії: огляд DESeq2

vignette(DESeq2)

Огляд DESeq2

RNA-Seq з Bioconductor у R

дослідження огляду

RNA-Seq з Bioconductor у R

робочий процес DESeq2

RNA-Seq з Bioconductor у R

Імпорт даних для DESeq2

# Read in raw counts
wt_rawcounts <- read.csv("fibrosis_wt_rawcounts.csv") 
View(wt_rawcounts)

сирі підрахунки fibrosis wt

RNA-Seq з Bioconductor у R

Імпорт даних для DESeq2: метадані

# Read in metadata
wt_metadata <- read.csv("fibrosis_wt_metadata_unordered.csv") 
View(wt_metadata)

метадані fibrosis wt

RNA-Seq з Bioconductor у R

Давайте потренуємось!

RNA-Seq з Bioconductor у R

Preparing Video For Download...