Підсумок аналізу диференційної експресії RNA-Seq

RNA-Seq з Bioconductor у R

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

робочий процес

RNA-Seq з Bioconductor у R

Підготовка RNA-Seq

RNA-Seq з Bioconductor у R

контроль якості

RNA-Seq з Bioconductor у R

Робочий процес RNA-Seq: контроль якості сирих даних

Забруднення послідовностей

RNA-Seq з Bioconductor у R

вирівнювання

RNA-Seq з Bioconductor у R

Робочий процес RNA-Seq: вирівнювання

Вирівнювання 2

RNA-Seq з Bioconductor у R

кількісна оцінка

RNA-Seq з Bioconductor у R

Робочий процес RNA-Seq: кількісна оцінка

лічильники

RNA-Seq з Bioconductor у R

повний робочий процес

RNA-Seq з Bioconductor у R

Підготовка до аналізу диференційної експресії: об'єкт DESeq2

dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = rawcounts,
                        colData = metadata,
                        design = ~ condition)

дані лічильників

RNA-Seq з Bioconductor у R

Давайте потренуємось!

RNA-Seq з Bioconductor у R

Preparing Video For Download...