มาสก์

การวิเคราะห์ภาพทางชีวการแพทย์ด้วย Python

Stephen Bailey

Instructor

ภาพดิบ

FullBrain

มาสก์ของภาพ

Mask

การสร้างมาสก์

การดำเนินการเชิงตรรกะให้ผลลัพธ์เป็น True / False ที่แต่ละพิกเซล

mat = np.array([[1, 2, 3],
                [4, 5, 6],
                [7, 8, 9]])

mat > 5

np.array([[False, False, False],
          [False, False, True ],
          [True,  True,  True ]])

ตัวอย่างการดำเนินการ

hist=ndi.histogram(im, 0, 255, 256)

mask1 = im > 32

ฮิสโตแกรมของภาพเท้า

มาสก์เท้า 1

mask2 = im > 64

mask3 = mask1 & ~mask2

มาสก์เท้า 2

มาสก์เท้า 1 และ 2

np.where(condition, x, y) ควบคุมว่าข้อมูลใดจะผ่านมาสก์

import numpy as np

im_bone = np.where(im > 64, im, 0)

plt.imshow(im_bone, cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()

ภาพที่ลบส่วนที่ไม่ใช่กระดูกออก

m = np.where(im > 64, 1, 0)

มาสก์เท้า 1

ndi.binary_dilation(m,iterations=5)

การขยายแบบไบนารีของมาสก์เท้า

ndi.binary_erosion(m,iterations=5)

การกัดเซาะแบบไบนารีของมาสก์เท้า

การวิเคราะห์ภาพทางชีวการแพทย์ด้วย Python