Фільтри

Біомедична обробка зображень у Python

Stephen Bailey

Instructor

Фільтри

Приклади відфільтрованих зображень

Біомедична обробка зображень у Python

Згортка з фільтром різкості

convolution-example

Біомедична обробка зображень у Python

Згортка з фільтром різкості

convolution-result

Біомедична обробка зображень у Python

Майкл Плотке — власна робота, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=24288958

Біомедична обробка зображень у Python

Майкл Плотке — власна робота, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=24288958

Біомедична обробка зображень у Python

Згортка зображення

import imageio.v2 as imageio
import scipy.ndimage as ndi

im=imageio.imread('foot-xray.jpg')

weights = [[.11, .11, .11], [.11, .12, .11], [.11, .11, .11]]
im_filt = ndi.convolve(im, weights)
fig, axes = plt.subplots(2, 1)
axes[0].imshow(im, cmap='gray')
axes[1].imshow(im_filt,cmap='gray')
plt.imshow()

згладжене рентген-зображення стопи

Біомедична обробка зображень у Python

Функції фільтрації

scipy.ndimage.filters містить:

  • median_filter()
  • uniform_filter()
  • maximum_filter()
  • percentile_filter()
ndi.median_filter(im, size=10)

рентген стопи після медіанного фільтра

Біомедична обробка зображень у Python

Гаусівська фільтрація

Гаусівський розподіл в 1 вимірі Гаусівський розподіл 1D

ndi.gaussian_filter(im, sigma=5)

Розмиття при sigma = 5

Гаусівський розподіл у 2 вимірах Kghose в англомовній Вікіпедії, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2550031

ndi.gaussian_filter(im, sigma=10)

Розмиття при sigma = 10

Біомедична обробка зображень у Python

Давайте потренуємось!

Біомедична обробка зображень у Python

Preparing Video For Download...