Маски

Біомедична обробка зображень у Python

Stephen Bailey

Instructor

Сире зображення

Увесь мозок

Маска зображення

Маска

Створення масок

Логічні операції дають True / False для кожного пікселя

mat = np.array([[1, 2, 3],
                [4, 5, 6],
                [7, 8, 9]])

mat > 5

np.array([[False, False, False],
          [False, False, True ],
          [True,  True,  True ]])

Приклади операцій

hist=ndi.histogram(im, 0, 255, 256)

mask1 = im > 32

гістограма стопи

маска стопи 1

mask2 = im > 64

mask3 = mask1 & ~mask2

маска стопи 2

маски стопи 1 і 2

np.where(condition, x, y) керує, які дані проходять крізь маску.

import numpy as np

im_bone = np.where(im > 64, im, 0)

plt.imshow(im_bone, cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()

зображення з вилученими немінеральними тканинами

m = np.where(im > 64, 1, 0)

маска стопи 1

ndi.binary_dilation(m,iterations=5)

бінарне розширення маски стопи

ndi.binary_erosion(m,iterations=5)

бінарна ерозія маски стопи

Біомедична обробка зображень у Python