Visualisering av logistiska GAM:er

Icke-linjär modellering med Generalized Additive Models (GAMs) i R

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

Transformera skalor

Log-odds-diagram

plot(binom_mod)

Konvertera partiella effekter

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Konvertera partiella effekter (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Lägga till ett intercept

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Lägga till ett intercept (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Inkludera interceptosäkerhet

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE)

Förbättra diagrammet

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE, 
     shade.col = "lightgreen", col = "purple")

Nu kör vi en övning!

Icke-linjär modellering med Generalized Additive Models (GAMs) i R