Візуалізація логістичних GAM

Нелінійне моделювання за допомогою узагальнених адитивних моделей (GAM) в R

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

Перетворення шкал

Графіки логітів

plot(binom_mod)

Перетворення часткових ефектів

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Перетворення часткових ефектів (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Додавання вільного члена

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Додавання вільного члена (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Урахування невизначеності вільного члена

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE)

Поліпшення графіка

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE, 
     shade.col = "lightgreen", col = "purple")

Давайте потренуємось!

Нелінійне моделювання за допомогою узагальнених адитивних моделей (GAM) в R