การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนเชิงเปรียบเทียบ

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

John Blischak

Instructor

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

เป้าหมายของการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนเชิงเปรียบเทียบคืออะไร?

  • ระบุยีนที่เชื่อมโยงกับฟีโนไทป์ที่สนใจ
  • ตัวอย่าง:
    • การตอบสนองต่อสิ่งกระตุ้น เช่น ยา
    • การเปลี่ยนแปลงระหว่างการพัฒนา
    • ผลของการกลายพันธุ์ทางพันธุกรรม
การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

ทำไมต้องใช้การวิเคราะห์การแสดงออกเชิงเปรียบเทียบ?

  • ความใหม่

    • มียีนที่น่าสนใจเพิ่มเติมอีกหรือไม่?
  • บริบท

    • ค่าที่วัดได้ของยีนนั้นพิเศษหรือพบได้ทั่วไป?
  • ระบบ

    • วิถีชีวภาพใดมีความสำคัญ?
การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

ขั้นตอนในการดำเนินการทดลองมีหลายขั้น

  • ออกแบบการศึกษา
  • ดำเนินการทดลอง
  • เก็บรวบรวมข้อมูล
  • ประมวลผลข้อมูลเบื้องต้น
  • สำรวจข้อมูล
  • ทดสอบข้อมูล
  • แปลผลลัพธ์
  • เผยแพร่ผลลัพธ์
การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

ข้อควรระวัง

  • ค่าที่วัดได้เป็นค่าสัมพัทธ์ ไม่ใช่ค่าสัมบูรณ์

  • วิธีทางสถิติไม่สามารถแก้ปัญหาการออกแบบการศึกษาที่บกพร่องได้

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

มาฝึกกันเถอะ!

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

Preparing Video For Download...