Аналіз диференційної експресії

Аналіз диференційної експресії з limma в R

John Blischak

Instructor

Аналіз диференційної експресії з limma в R

Аналіз диференційної експресії з limma в R

Аналіз диференційної експресії з limma в R

Аналіз диференційної експресії з limma в R

Аналіз диференційної експресії з limma в R

Яка мета аналізу диференційної експресії?

  • Визначити гени, пов'язані з потрібним фенотипом
  • Приклади:
    • Відповідь на стимул, як-от лікарський засіб
    • Зміни під час розвитку
    • Вплив генетичної мутації
Аналіз диференційної експресії з limma в R

Навіщо диференційна експресія?

  • Новизна

    • Чи є додаткові гени, на які варто звернути увагу?

  • Контекст

    • Чи унікальне чи типове значення для цього гена?

  • Системи

    • Які біологічні шляхи важливі?
Аналіз диференційної експресії з limma в R

Багато кроків для завершення експерименту

  • Спроєктувати дослідження
  • Провести експеримент
  • Зібрати дані
  • Попередньо обробити дані
  • Дослідити дані
  • Перевірити дані
  • Інтерпретувати результати
  • Поділитися результатами
Аналіз диференційної експресії з limma в R

Застереження

  • Вимірювання відносні, а не абсолютні

  • Статистичні методи не врятують погано спроєктоване дослідження

Аналіз диференційної експресії з limma в R

Давайте потренуємось!

Аналіз диференційної експресії з limma в R

Preparing Video For Download...