Hypotestest
Fallstudier i statistiskt tänkande
Justin Bois
Lecturer, Caltech
Mutationens effekt på aktivitet
1 Data med tillstånd av Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou och David Prober, Caltech
Genotypdefinitioner
- Vildtyp: Inga mutationer
- Heterozygot: Mutation på en av två kromosomer
- Mutant: Mutation på båda kromosomerna
Mutationens effekt på aktivitet
1 Data med tillstånd av Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou och David Prober, Caltech
Mutationens effekt på aktivitet
1 Data med tillstånd av Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou och David Prober, Caltech
Hypotestest
Bedömning av hur rimliga observerade data är under antagandet att en hypotes stämmer
p-värde
Sannolikheten att få ett värde på din teststatistika som är minst lika extremt som det observerade, under antagandet att nollhypotesen stämmer
Teststatistika
- Ett enskilt tal som kan beräknas från observerade data och från data du simulerar under nollhypotesen
- Fungerar som jämförelsebas
p-värde
Sannolikheten att få ett värde på din teststatistika som är minst lika extremt som det observerade, under antagandet att nollhypotesen stämmer
Kräver tydlig specifikation av:
- Nollhypotes som kan simuleras
- Teststatistika som kan beräknas från observerade och simulerade data
- Definition av minst lika extremt som
Steg för hypotestestning
- Formulera nollhypotesen tydligt
- Definiera din teststatistika
- Generera många uppsättningar simulerade data under antagandet att nollhypotesen stämmer
- Beräkna teststatistikan för varje simulerad datamängd
- p-värdet är andelen simulerade datamängder där teststatistikan är minst lika extrem som för de verkliga data
Specificera testet
Nollhypotes: de aktiva boutlängderna hos vildtyps- och heterozygosfisk är identiskt fördelade
Teststatistika: Skillnad i medelvärde för aktiv boutlängd mellan heterozygoter och vildtyp
Minst lika extremt som: Teststatistikan är större än eller lika med det observerade värdet
