การทดสอบสมมติฐาน

กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

Justin Bois

Lecturer, Caltech

ผลของการกลายพันธุ์ต่อกิจกรรม

1 ข้อมูลจาก Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou และ David Prober, Caltech
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

นิยามของจีโนไทป์

  • Wild type: ไม่มีการกลายพันธุ์

  • Heterozygote: กลายพันธุ์บนโครโมโซมหนึ่งในสองแท่ง

  • Mutant: กลายพันธุ์บนโครโมโซมทั้งสองแท่ง
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

ผลของการกลายพันธุ์ต่อกิจกรรม

1 ข้อมูลจาก Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou และ David Prober, Caltech
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

ผลของการกลายพันธุ์ต่อกิจกรรม

1 ข้อมูลจาก Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou และ David Prober, Caltech
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

การทดสอบสมมติฐาน

การประเมินว่าข้อมูลที่สังเกตได้มีความสมเหตุสมผลเพียงใด ภายใต้สมมติฐานที่กำหนด

กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

p-value

ความน่าจะเป็นที่จะได้ค่าสถิติทดสอบที่รุนแรงอย่างน้อยเท่ากับที่สังเกตได้ ภายใต้สมมติฐานว่าสมมติฐานหลักเป็นจริง

กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

สถิติทดสอบ

  • ตัวเลขเดียวที่คำนวณได้จากข้อมูลจริงและข้อมูลที่จำลองภายใต้สมมติฐานหลัก

  • ใช้เป็นเกณฑ์เปรียบเทียบ
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

p-value

ความน่าจะเป็นที่จะได้ค่าสถิติทดสอบที่รุนแรงอย่างน้อยเท่ากับที่สังเกตได้ ภายใต้สมมติฐานว่าสมมติฐานหลักเป็นจริง

ต้องระบุให้ชัดเจน:

  • สมมติฐานหลักที่สามารถจำลองได้
  • สถิติทดสอบที่คำนวณได้จากข้อมูลจริงและข้อมูลจำลอง
  • นิยามของรุนแรงอย่างน้อยเท่ากับ
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

ขั้นตอนการทดสอบสมมติฐาน

  • ระบุสมมติฐานหลักให้ชัดเจน
  • กำหนดสถิติทดสอบ
  • สร้างชุดข้อมูลจำลองจำนวนมากภายใต้สมมติฐานหลัก
  • คำนวณสถิติทดสอบสำหรับแต่ละชุดข้อมูลจำลอง
  • p-value คือสัดส่วนของชุดข้อมูลจำลองที่มีสถิติทดสอบรุนแรงอย่างน้อยเท่ากับข้อมูลจริง
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

การกำหนดรายละเอียดการทดสอบ

สมมติฐานหลัก: ความยาวช่วงกิจกรรมของปลา wild type และ heterozygote มีการแจกแจงเหมือนกัน

สถิติทดสอบ: ผลต่างของค่าเฉลี่ยความยาวช่วงกิจกรรมระหว่าง heterozygote กับ wild type

รุนแรงอย่างน้อยเท่ากับ: สถิติทดสอบมีค่ามากกว่าหรือเท่ากับที่สังเกตได้

กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

Permutation test

สำหรับแต่ละ replicate:

  • สลับ label ของจุดข้อมูล
  • คำนวณสถิติทดสอบ
perm_reps = dcst.draw_perm_reps(
    data_a, data_b, dcst.diff_of_means, size=10000
)

p-value คือสัดส่วนของ replicate ที่รุนแรงอย่างน้อยเท่ากับที่สังเกตได้

p_val = np.sum(perm_reps >= diff_means_obs) / len(perm_reps)
กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

มาฝึกกันเถอะ!

กรณีศึกษาด้านการคิดเชิงสถิติ

Preparing Video For Download...