Лінійні регресії та парний бутстреп
Кейс-стаді зі статистичного мислення
Justin Bois
Lecturer, Caltech
Ріст бактерій
1 Зображення надані Jin Park і Michael Elowitz, Caltech
Ріст бактерій
_ = plt.semilogy(t, bac_area, marker='.', linestyle='none')
_ = plt.xlabel('time (hr)')
_ = plt.ylabel('area (sq. µm)')
plt.show()
Лінійна регресія з np.polyfit()
slope, intercept = np.polyfit(t, bac_area, 1)
t_theor = np.array([0, 14])
bac_area_theor = slope * t_theor + intercept
_ = plt.plot(t, bac_area, marker='.', linestyle='none')
_ = plt.plot(t_theor, bac_area_theor)
_ = plt.xlabel('time (hr)')
_ = plt.ylabel('area (sq. µm)')
plt.show()
Регресія росту бактерій
Напівлог-лінійна регресія з np.polyfit()
slope, intercept = np.polyfit(t, np.log(bac_area), 1)
t_theor = np.array([0, 14])
bac_area_theor = np.exp(slope * t_theor + intercept)
_ = plt.semilogy(t, bac_area, marker='.', linestyle='none')
_ = plt.semilogy(t_theor, bac_area_theor)
_ = plt.xlabel('time (hr)')
_ = plt.ylabel('area (sq. µm)')
plt.show()
Регресія росту бактерій
Парний бутстреп
- Перевибирайте дані парами
- Обчисліть кутовий коефіцієнт і перетин за перевибраними даними
- Кожен кутовий коефіцієнт і перетин — це бутстреп-реплікована оцінка
- Обчисліть довірчі інтервали з перцентилів бутстреп-реплік
Парний бутстреп
# Draw 10000 pairs bootstrap reps slope_reps, int_reps = dcst.draw_bs_pairs_linreg( x_data, y_data, size=10000 )# Compute 95% confidence interval of slope slope_conf_int = np.percentile(slope_reps, [2.5, 97.5])
